甘孜州地理独特，地处祖国最高一级阶梯向第二极阶梯云贵高原和四川盆地过渡地带，属横断山北段川西高山高原区，青藏高原的一部分。境内山峰高耸，河谷幽深。

地势由西北向东南倾斜，北高南低，中部突起，东南缘深切，地面平均海拔3500火米。5000米以上山岭，终年积雪，冰川发育。最高峰贡嘎山7556 米，其东坡的大渡河谷地，水平间仅隔29公里，而相对高差达6400米。地貌分为高原、山原、高山峡谷三大类型。